Escritor y filósofo. Nació en Bilbao en 1951 y cursó la formación primaria en Lejona (Vizcaya). A finales de los sesenta y principios de los setenta, durante sus primeros estudios universitarios, se implicó en grupos de extrema izquierda; aunque pronto evolucionaría en ideas políticas. Fichado por la policía, se trasladó a Sevilla para estudiar Filología Románica antes de regresar a la Universidad de Deusto para doctorarse. Hacia 1974 abandonó cualquier radicalismo político y pasó a dedicarse casi exclusivamente a su labor docente, primero como profesor de educación básica y desde 1977 como docente de instituto.
Entre 1980 y 1986 militó en el Partido Comunista de España (PCE) y en 1987 ingresó en el Partido Socialista Obrero Español (PSOE) únicamente, según su propia expresión, «por imperativos éticos» y como gesto testimonial a causa de un sangriento atentado contra la Casa del Pueblo de Portugalete. Socialdemócrata en los años ochenta, Juaristi ha evolucionado hacia una ideología netamente liberal abandonando cualquier militancia política. Autodeclarado «nacionalista español», se ha dedicado a denunciar la manipulación de los mitos vascos que justifican la imposición nacionalista y la barbarie etarra. De hecho, en 1997 fue uno de los fundadores del Foro de Ermua y es constante su apoyo a otras asociaciones contra el terrorismo como el movimiento ¡Basta Ya!
Amenazado por ETA, abandonó su cátedra de Filología Española en la Universidad del País Vasco para residir en la capital de España. Desde entonces ha desempeñado importantes cargos, como director de la Biblioteca Nacional de España (2001-2004) y del Instituto Cervantes (2001-2004). En la actualidad es catedrático de Filología Hispánica en la Universidad de Alcalá de Henares.
Ha publicado varios libros de poesía –Diario de un poeta recién cansado (1986), Suma de varia intención (1987), Arte de marear (1988), Los paisajes domésticos (1992), Mediodía (1993), Tiempo desapacible (1996), Poesía reunida (1986-1999) (2001), Prosas en verso (2002)-, de narrativa –La leyenda de Jaun Zuria (1980), La caza salvaje (2007; Premio Azorín de Novela)- y un buen número de ensayos: El linaje de Aitor. La invención de la tradición vasca (1984), Literatura vasca (1987), Vestigios de Babel. Para una arqueología de los nacionalismos españoles (1992), Auto de Terminación: raza, nación y violencia en el País Vasco (1994), El chimbo expiatorio (la invención de la tradición bilbaína, 1876-1939) (1994), El bucle melancólico. Historias de nacionalistas vascos (1997), premiado con el Premio Nacional de Literatura y el Premio Espasa de Ensayo, Sacra nemesis. Nuevas historias de nacionalistas vascos (1999), Sermo humilis: poesía y poética (1999), El bosque originario (2000), La tribu atribulada. El Nacionalismo Vasco explicado a mi padre (2002), El reino del ocaso (2004), etc.